综合学习了数据挖掘理论、基于python的网络爬虫、利用R语言包抓取网站数据,学习了数据挖掘中的聚类、分类、推荐等基础算法。而且用python完成了携程,去哪儿,同程旅游网,驴妈妈,微信公众号的数据采集与爬取,详细信息在我的代码库中。
曾从事过基因组学、蛋白质组学、生物信息学和药物组学等领域的研究。利用计算机、统计学、数学等学科来解决生物学问题。主要针对人类各种癌症的发病机制进行研究,包括肝癌、肺癌、直肠癌等。提出了最小生成树算法来研究与肺癌相关子通路。参与国家自然科学基金项目(2 项)和浙江省杰出青年科学基金项目研究(1项)。先后在PLoS ONE、IET System Biology、Computational biology and chemistry等国际期刊发表SCI论文3篇。
2012.09 - 2020.07 科研项目经历 学生
参与导师的国家自然科学基金项目(2 项)和浙江省杰出青年科学基金项目研究(1项)以及国家高技术研究发展计划(863计划)项目与广东省科技计划重点项目
● 发表论文6篇,申请发明专利1项。
1. 肖碧玉,李先彬,刘文斌*. 基于图元向量的差异共表达分析研究. 电子学报.(已录用, EI)
2. 肖碧玉,李先彬,刘文斌*.比较图元向量和点的聚类系数对差异网络的研究,生物信息学. 2013,11(4):264-270
3. Xianbin Li , Liangzhong Shen, Xuequn Shang, Wenbin Liu*. Subpathway analysis based on signaling-pathway impact analysis of signaling pathway. PLoS ONE 2015,10(7):e0132813. DOI:10.1371/journal.pone.0132813.
4. 王萍,李先彬,刘文斌*. 基于基因差异共表达的子通路分析方法研究[J].计算机技术与发展 中国核心期刊2B级
5. Zhenshen Bao, Xianbin Li, Xiangzhen Zan, Liangzhong Shen, Runnian Ma, Wenbin Liu*. Signaling pathway impact analysis based on the strength of interaction between genes. IET System Biology. doi:10.1049/iet-syb.2016.0089. 04/2016
6. Fang H, Li X, Zan X, Shen L, Ma R, Liu W. Signaling pathway impact analysis by incorporating the importance and specificity of genes (SPIA-IS). Comput Biol Chem. 2017; 71:236–244. doi: 10.1016/j.compbiolchem.2017.09.009
● 专利项目
软件著作权:基于图元向量的差异网络分析软件(V1.0),2013SR055076
个人的代码库:https://github.com/eshinesimida
个人的谷歌学术citation:https://scholar.google.com/citations?user=ir5-NVoAAAAJ&hl=zh-CN