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上海其它兼职程序员

ID：206595

眠洲

生物信息工程师

公司信息：
上海宇道生物技术有限公司

工作经验：
2年

兼职日薪：
500元/8小时

兼职时间：
下班后
周六
周日
可工作日远程
可工作日驻场（离职原因）
可工作日驻场（自由职业原因）

所在区域：
上海
徐汇

技术能力

• 编程语言: Python, R, SQL, Shell, Javascript
• 操作系统, 数据库与工程构建: Linux(CentOS/Arch/Manjaro/Debian)/MySQL/MongoDB/Git
• 容器与环境搭建: Docker/conda/venv/frp
• 前端框架: Bootstrap/Vue

项目经验

宇道生物技术有限公司 | UCDOM, 生物信息工程师
2018.12-2020.7
• 独立负责在职期间该公司绝大多数生物信息学业务
– 蛋白与药物分子的 docking/药物虚拟筛选与评估/蛋白同源建模/评估打分
– 高通量测序 & 芯片数据的后续处理
– 基于 R 的数据可视化
– 数据采集: Python 爬虫
• 独立负责在职期间该公司计算服务器运维工作
– 科学计算环境搭建: JupyterLab/R-Studio Server
– 部分系统性能调优: Linux 内核裁剪编译/改写已有项目以实现并行化运算
• 独立开发基于 cas-offinder 的 CRISPR/Cas9 脱靶位点预测程序,并参与后续机器学习项目的开发 (使
用随机森林/SVM)
• 独立开发某变构药物结合位点预测程序的 1.0 版本,并参与后续版本的开发工作,项目尚未公开
• 协助开发 ACISS 实验室管理系统中药物分子结构可视化相关模块 (基于 RDKit)

案例展示

uniprot2IBS

该项目脚本用于将 uniprot 格式的蛋白质二级结构信息快速转化为 IBS 格式的 project file,以快速准确绘制蛋白质二级结构涉及爬虫相关技术
某基因睾丸癌中的致病机制研究

(UNPUBLISHED) 某基因在睾丸癌中的致病机制研究, 负责本文中生物信息学及数据可视化工作
某基因睾丸癌中的致病机制研究

(UNPUBLISHED) 某基因在睾丸癌中的致病机制研究, 负责本文中生物信息学及数据可视化工作